Anteriormente, a Pokémon Island era apenas uma ilha Pokémon, havia muito poucas pessoas, a maioria eram pesquisadores como o ilustre professor Oak que estudava os pokémons da ilha. No entanto, há três anos, a existência do Mew Pokémon foi comprovada dentro da ilha e como este era um Pokémon muito raro, ele atraiu uma multidão com muitos treinadores a procura do Mew, e agora a ilha está cheia de pessoas.
Muitos deles eram bem qualificados e famosos, então outros foram para este desafio na ilha, então a ilha tornou-se um grande ponto de batalhas que levou à criação de muitos torneios que também trouxe muitos espectadores. Muitas coisas aconteceram nos últimos três anos, um grande local de batalha foi criado e chamado de “O Coliseu” onde treinadores foram treinados e foram conhecidos por estarem lá. Aqueles que fizeram muitos torneios tiveram uma classificação elevada e com isso ganhou vários tipos de tratamento exclusivo como melhores itens, pokémons, locais, serviços, etc.
Muitos novos Pokémon foram descobertos na ilha, outros foram lançados por treinadores, e até mesmo alguns foram às lojas. A maioria foi descoberta por exploradores que vivem em lugares nunca visitados antes. Alguns lugares foram criados para aumentar a diversidade de pokémon crescendo cada vez mais. E essa é a história deste lugar, a Pokémon Island.