Ninja Alien: Survival Arena coloca os jogadores numa ação de Arena, usando de um sistema dinâmico de combate de espadas, com grande variedade de espadas para desbloquear e usar contra hordas de inimigos, chefes e muitas outras ameaças. O jogo retrata que durante o Japão Feudal, os alienígenas chegaram à Terra, atacando aldeias e forçando as pessoas a escapar para áreas rurais; mas os visitantes agora terão que lidar com um herói lendário - você! Vamos afastar todos os alienígenas.
Combate de espadas totalmente dinâmico, elimine ondas de inimigos e chefes exclusivos, usando de suas habilidades que são escolhidas conforme completa a barra de EXP ao derrotar os inimigos. Vamos ainda personalizar seu ninja com várias skins para suas armas, além de máscaras famosas. Há mais de 20 espadas para desbloquear e seguir com sua missão de varrer esses aliens para fora do planeta.
Através de vários mapas e um novo mundo para explorar, coletar diversos itens que serão necessários para desenvolvimentos de poções, assim como habilidades para fatiar os inimigos. Consuma porções para aumentarem seus atributos, temos de ficar cada vez mais forte, enquanto explorar diversos locais do Japão que foram tomadas pelos invasores.